Barn- och ungdomskardiologi har funnits i Lund sedan 1963. Sektionen grundades av Nils-Rune Lundström som har varit en av pionjärerna när det gäller utveckling av ekokardiografi på barn med medfödda hjärtfel och som 1990 blev landets första professor i barn- och ungdomskardiologi. Utvecklingen av barnkardiologin i Lund har skett i nära samarbete med barnhjärtkirurgi, barnanestesi och röntgen.
År 2001 flyttade all barnhjärtverksamhet in i nya Barn- och Ungdomssjukhuset och samarbetet intensifierades ytterligare.
Under det senaste decenniet har kateterburna behandlingsmetoder utvecklats starkt, för flera hjärtfel är idag kateterburen teknik standardmetod. Nya tekniker är under etablering, som hybridkirurgi och kateterburen implantation av klaffproteser.